1988年3月向教育部提出申請，1989年6月獲教育部核准籌設「長榮工學院」，並於當年8月成立長榮工學院董事會，由長榮中學校友會總會長高育仁先生榮任董事長。 1992年11月奉准改為長榮管理學院，聘請林邦充教授為首任院長，設「資訊管理」、「企業管理」、「國際企業」、「會計」等四個學系，並參加82學年度大學聯招，獲核定招收新生二百名。之後，於2002年10月奉教育部核定改名為「長榮大學」。 本校在董事會及校長領導下，積極辦學，建立制度，創造特色。迄今，設有管理、健康科學、人文社會、資訊暨工程、神學等五個學院及博雅教育學部，25個系（含15個碩士班）、5個學士學位學程（1個學士後）、1個博士班、4個獨立研究所，4個教學中心及其他學制（如二年制在職專班、進修學士班等）。